狗耳朵很干净但总甩头的原因：

1、很可能是它的耳朵上长癣导致的，而且它会经常用腿去挠它的耳朵，最好给它做好清洁之后，喷上药水等待恢复。

2、狗狗被自己挠伤之后，在愈合的时候就会显得非常痒，继而导致它出现不停甩头的现象，最好给它带上防舔圈，避免它再次抓挠，导致出现新的伤口。

3、狗狗的耳朵进入异物，或者因为皮肤太干燥，也会导致它出现甩头的行为，并且还会用腿去抓耳朵，最好及时给它将异物取出来，并多给它补充水分。

4、可能是因为狗狗的头部有跳蚤、虱子、螨虫等寄生虫导致。

5、也可能是狗狗的耳道内进水、感染真菌等因素引起的，建议主人仔细查看狗狗的头部以及周围是否存在异常。